小程序备案和APP备案虽然都是为了在互联网上提供服务而进行的备案，但它们之间存在一些区别。

首先，小程序备案和APP备案的申请主体不同。小程序备案的申请主体为小程序开发者或管理员，而APP备案的申请主体则为APP开发者或管理员。

其次，小程序备案和APP备案的范围也不同。小程序备案主要针对小程序应用本身进行备案，包括小程序的基本信息、开发者信息、审核信息等。而APP备案则是对整个APP应用进行备案，包括APP的基本信息、开发者信息、审核信息、版本信息等。

再次，小程序备案和APP备案的审核标准也不同。小程序备案一般审核较快，因为其审核范围相对较小，而APP备案则审核较为严格，因为其审核范围较大，需要进行全面的安全性和合规性审核。
小程序备案和APP备案的证书也不同。小程序备案获得的是小程序开发者证书，而APP备案获得的是APP开发者证书。

，小程序备案和APP备案存在申请主体、范围、审核标准以及证书等方面的区别。因此，在申请备案时需要根据具体情况选择相应的方式进行申请。